CpG দ্বীপ খুঁজুন

CpG দ্বীপ কীভাবে খুঁজবেন

1. একটি DNA সিকোয়েন্স সাধারণ লেখা বা FASTA হিসেবে সেঁটে দিন।
2. চলতি সীমাগুলো (200 বেসের জানালা, অন্তত 50% GC আর অন্তত 0.6 পর্যবেক্ষিত/প্রত্যাশিত CpG) রেখে দিন, বা বদলে নিন।
3. যে জানালাগুলো উতরে যায়, সেগুলো মিলিয়ে অঞ্চল বানানো হয়, আর তাদের দৈর্ঘ্য, GC-র পরিমাণ আর পর্যবেক্ষিত/প্রত্যাশিত CpG-সহ তালিকায় আনা হয়।

সাধারণ প্রশ্ন

পর্যবেক্ষিত/প্রত্যাশিত CpG কীভাবে বের হয়?

CG ডাইনিউক্লিওটাইডের সংখ্যা গুণ জানালার দৈর্ঘ্য, ভাগ C-র সংখ্যা গুণ G-র সংখ্যা।

আমার সিকোয়েন্স কি আপলোড হয়?

না। সবকিছু আপনার ব্রাউজারেই চলে, তাই আপনার সিকোয়েন্স কখনো যন্ত্র ছেড়ে যায় না।