CpG アイランド検索
CpG アイランドを探す方法
- DNA 配列を、プレーンテキストか FASTA で貼り付けます。
- 一般的なしきい値(200 塩基のウィンドウ、GC 50% 以上、CpG 観測/期待比 0.6 以上)のまま使うか、変更します。
- 条件を満たしたウィンドウは領域にまとめられ、長さ、GC 含量、CpG 観測/期待比とともに表示されます。
よくある質問
CpG 観測/期待比はどう計算しますか?
CG ジヌクレオチドの数にウィンドウの長さを掛け、C の数と G の数の積で割ります。
配列はアップロードされますか?
いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。