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CpG アイランド検索

CpG アイランドを探す方法

  1. DNA 配列を、プレーンテキストか FASTA で貼り付けます。
  2. 一般的なしきい値(200 塩基のウィンドウ、GC 50% 以上、CpG 観測/期待比 0.6 以上)のまま使うか、変更します。
  3. 条件を満たしたウィンドウは領域にまとめられ、長さ、GC 含量、CpG 観測/期待比とともに表示されます。

よくある質問

CpG 観測/期待比はどう計算しますか?

CG ジヌクレオチドの数にウィンドウの長さを掛け、C の数と G の数の積で割ります。

配列はアップロードされますか?

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。

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