Pencari Pulau CpG
Cara menemukan pulau CpG
- Tempel sekuens DNA, sebagai teks biasa atau FASTA.
- Pakai ambang biasa (jendela 200 basa, GC minimal 50%, dan CpG teramati/harapan minimal 0,6) atau ubah.
- Jendela yang lolos digabung menjadi wilayah, dicantumkan dengan panjang, kandungan GC, dan CpG teramati/harapan.
Pertanyaan umum
Bagaimana CpG teramati/harapan dihitung?
Jumlah dinukleotida CG dikali panjang jendela, dibagi jumlah C dikali jumlah G.
Apakah sekuens saya diunggah?
Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.
Alat sekuens DNA dan protein lainnya
Komplemen BalikDNA ke RNAGabungkan Sekuens FASTAPecah Sekuens FASTAGenBank ke FASTAEMBL ke FASTAEkstraktor Fitur GenBankEkstraktor Fitur EMBLEkstraktor Translasi GenBankEkstraktor Translasi EMBLPecah Menjadi KodonEkstraktor Rentang DNAEkstraktor Rentang ProteinEkstraktor Jendela DNAEkstraktor Jendela ProteinBersihkan DNABersihkan ProteinKelompokkan DNAKelompokkan ProteinAsam Amino Satu ke Tiga HurufAsam Amino Tiga ke Satu HurufStatistik DNAStatistik ProteinPenggunaan KodonBerat Molekul DNABerat Molekul ProteinTitik Isoelektrik ProteinGRAVY ProteinCari Pola DNACari Pola ProteinPencarian Mirip DNAPencarian Mirip ProteinIdentitas dan KemiripanPencari ORFTranslasi DNA ke ProteinTranslasi BalikTranslasi Balik Penyejajaran ProteinStatistik Primer PCRProduk PCRRingkasan RestriksiMutasi untuk DigestiSejajarkan Dua DNASejajarkan Dua ProteinSejajarkan KodonPeta RestriksiPeta TranslasiPeta PrimerWarnai Penyejajaran Menurut KonservasiWarnai Penyejajaran Menurut SifatPlot KodonSekuens DNA AcakSekuens Protein AcakDNA Penyandi AcakWilayah DNA AcakWilayah Protein AcakSampel DNASampel ProteinAcak Urutan DNAAcak Urutan ProteinMutasikan DNAMutasikan ProteinKode GenetikKode IUPAC