Localizador de ilhas CpG
Como encontrar ilhas CpG
- Cole uma sequência de DNA, como texto ou em FASTA.
- Mantenha os limites usuais (janela de 200 bases, pelo menos 50% de GC e CpG observado/esperado de pelo menos 0,6) ou altere-os.
- As janelas que passam são unidas em regiões, listadas com comprimento, conteúdo de GC e CpG observado/esperado.
Perguntas frequentes
Como o CpG observado/esperado é calculado?
O número de dinucleotídeos CG vezes o comprimento da janela, dividido pelo número de C vezes o número de G.
Minha sequência é enviada?
Não. Tudo roda no seu navegador, então suas sequências nunca saem do seu dispositivo.
Mais ferramentas de sequências de DNA e proteína
Complemento reversoDNA para RNACombinar sequências FASTADividir sequência FASTAGenBank para FASTAEMBL para FASTAExtrator de features GenBankExtrator de features EMBLExtrator de traduções GenBankExtrator de traduções EMBLDividir em códonsExtrator de intervalos de DNAExtrator de intervalos de proteínaExtrator de janelas de DNAExtrator de janelas de proteínaLimpar DNALimpar proteínaAgrupar DNAAgrupar proteínaAminoácidos de uma para três letrasAminoácidos de três para uma letraEstatísticas de DNAEstatísticas de proteínaUso de códonsPeso molecular de DNAPeso molecular de proteínaPonto isoelétrico de proteínaGRAVY de proteínaBuscar padrão em DNABuscar padrão em proteínaBusca aproximada em DNABusca aproximada em proteínaIdentidade e similaridadeLocalizador de ORFTraduzir DNA em proteínaTradução reversaTradução reversa de um alinhamento de proteínasAnálise de primers de PCRProdutos de PCRResumo de restriçãoMutar para digestãoAlinhar dois DNAAlinhar duas proteínasAlinhar códonsMapa de restriçãoMapa de traduçãoMapa de primersColorir alinhamento por conservaçãoColorir alinhamento por propriedadesGráfico de códonsSequência de DNA aleatóriaSequência de proteína aleatóriaDNA codificante aleatórioRegiões de DNA aleatóriasRegiões de proteína aleatóriasAmostrar DNAAmostrar proteínaEmbaralhar DNAEmbaralhar proteínaMutar DNAMutar proteínaCódigos genéticosCódigos IUPAC