CpG-Insel-Finder

So findest du CpG-Inseln

1. Füge eine DNA-Sequenz ein, als Text oder FASTA.
2. Behalte die üblichen Schwellen bei (ein Fenster von 200 Basen, mindestens 50 % GC und ein beobachtetes/erwartetes CpG von mindestens 0,6) oder ändere sie.
3. Fenster, die bestehen, werden zu Regionen zusammengefasst und mit Länge, GC-Gehalt und beobachtetem/erwartetem CpG aufgelistet.

Häufige Fragen

Wie wird beobachtetes/erwartetes CpG berechnet?

Die Anzahl der CG-Dinukleotide mal Fensterlänge, geteilt durch die Anzahl C mal die Anzahl G.

Wird meine Sequenz hochgeladen?

Nein. Alles läuft in deinem Browser, deine Sequenzen verlassen dein Gerät also nicht.