CpG-Insel-Finder
So findest du CpG-Inseln
- Füge eine DNA-Sequenz ein, als Text oder FASTA.
- Behalte die üblichen Schwellen bei (ein Fenster von 200 Basen, mindestens 50 % GC und ein beobachtetes/erwartetes CpG von mindestens 0,6) oder ändere sie.
- Fenster, die bestehen, werden zu Regionen zusammengefasst und mit Länge, GC-Gehalt und beobachtetem/erwartetem CpG aufgelistet.
Häufige Fragen
Wie wird beobachtetes/erwartetes CpG berechnet?
Die Anzahl der CG-Dinukleotide mal Fensterlänge, geteilt durch die Anzahl C mal die Anzahl G.
Wird meine Sequenz hochgeladen?
Nein. Alles läuft in deinem Browser, deine Sequenzen verlassen dein Gerät also nicht.
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