Zwei Proteine alignieren

So alignierst du zwei Proteinsequenzen

1. Füge die beiden Proteinsequenzen ein.
2. Lege Lückeneröffnungs- und Lückenverlängerungsstrafe fest, und setze das Häkchen bei Endlücken ohne Strafe, wenn eine Sequenz ein Fragment der anderen ist.
3. Klicke auf Alignieren, um das Alignment mit Identität, Ähnlichkeit, Lücken und Score zu sehen.

Häufige Fragen

Welche Bewertungsmatrix wird verwendet?

BLOSUM62, mit einem globalen Alignment (Needleman-Wunsch) und affinen Lückenstrafen.

Was bedeuten die Zeichen zwischen den Zeilen?

Ein senkrechter Strich markiert identische Reste, ein Doppelpunkt ähnliche.

Wird meine Sequenz hochgeladen?

Nein. Alles läuft in deinem Browser, deine Sequenzen verlassen dein Gerät also nicht.