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2本のタンパク質をアライン

2本のタンパク質配列をアラインする方法

  1. 2本のタンパク質配列を貼り付けます。
  2. ギャップ開始・伸長のペナルティを設定します。一方の配列がもう一方の断片なら、末端ギャップを無料にするにチェックを入れます。
  3. アラインをクリックすると、同一性、類似性、ギャップ、スコア付きのアラインメントが表示されます。

よくある質問

どのスコア行列を使いますか?

BLOSUM62 を使い、アフィンギャップペナルティによるグローバルアラインメント(Needleman-Wunsch)を行います。

行の間の記号は何ですか?

縦棒は同一の残基、コロンは類似した残基を表します。

配列はアップロードされますか?

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。

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