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同一性と類似性

同一性と類似性を計算する方法

  1. ギャップを - で書いた FASTA 形式のアラインメントを貼り付けます。
  2. DNA かタンパク質かを選びます。
  3. 配列のペアごとに、比較した位置の数、同一性、タンパク質なら類似性が表示されます。

よくある質問

どの位置を比較しますか?

どちらの配列にもギャップがない位置です。同一性と類似性はその位置数に対する割合です。

何を類似とみなしますか?

同じグループの残基です:GAVLI、FYW、CM、ST、KRH、DENQ、P。

配列はアップロードされますか?

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。

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