Identité et similarité
Comment calculer l’identité et la similarité
- Collez un alignement au format FASTA, avec les gaps notés -.
- Choisissez s’il s’agit d’ADN ou de protéine.
- Chaque paire de séquences est listée avec le nombre de positions comparées, l’identité et, pour les protéines, la similarité.
Questions fréquentes
Quelles positions sont comparées ?
Les positions où aucune des deux séquences n’a de gap. L’identité et la similarité sont des pourcentages de ces positions.
Qu’est-ce qui compte comme similaire ?
Les résidus d’un même groupe : GAVLI, FYW, CM, ST, KRH, DENQ et P.
Ma séquence est-elle envoyée ?
Non. Tout fonctionne dans votre navigateur : vos séquences ne quittent jamais votre appareil.
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