Identité et similarité

Comment calculer l’identité et la similarité

1. Collez un alignement au format FASTA, avec les gaps notés -.
2. Choisissez s’il s’agit d’ADN ou de protéine.
3. Chaque paire de séquences est listée avec le nombre de positions comparées, l’identité et, pour les protéines, la similarité.

Questions fréquentes

Quelles positions sont comparées ?

Les positions où aucune des deux séquences n’a de gap. L’identité et la similarité sont des pourcentages de ces positions.

Qu’est-ce qui compte comme similaire ?

Les résidus d’un même groupe : GAVLI, FYW, CM, ST, KRH, DENQ et P.

Ma séquence est-elle envoyée ?

Non. Tout fonctionne dans votre navigateur : vos séquences ne quittent jamais votre appareil.