Rechercher un motif

Comment trouver un motif dans l’ADN ou une protéine

1. Choisissez ADN ou protéine dans Type de séquence, puis collez la séquence, en texte brut ou en FASTA.
2. Tapez le motif. Dans l’ADN, les codes IUPAC comme W ou N correspondent à n’importe laquelle de leurs bases ; dans une protéine, X correspond à n’importe quel résidu.
3. Chaque occurrence est listée avec son début et sa fin, et pour l’ADN son brin.

Questions fréquentes

Puis-je utiliser une expression régulière ?

Oui. Un motif contenant des caractères comme [ ] ( ) * + ou ? est utilisé comme expression régulière, par exemple GC[AT]{2,4}GC.

Que trouve N[^P][ST][^P] ?

Le motif de N-glycosylation : asparagine, puis n'importe quel résidu sauf la proline, puis sérine ou thréonine, puis n'importe quel résidu sauf la proline.

Ma séquence est-elle envoyée ?

Non. Tout fonctionne dans votre navigateur : vos séquences ne quittent jamais votre appareil.