Muster finden

So findest du ein Motiv in DNA oder einem Protein

1. Wähle unter Sequenztyp DNA oder Protein und füge die Sequenz ein, als Text oder FASTA.
2. Gib das Muster ein. In DNA passen IUPAC-Codes wie W oder N auf jede ihrer Basen; in einem Protein passt X auf jeden Rest.
3. Jeder Treffer wird mit Anfang und Ende aufgeführt, bei DNA auch mit dem Strang.

Häufige Fragen

Kann ich einen regulären Ausdruck verwenden?

Ja. Ein Muster mit Zeichen wie [ ] ( ) * + oder ? wird als regulärer Ausdruck verwendet, zum Beispiel GC[AT]{2,4}GC.

Was findet N[^P][ST][^P]?

Das N-Glykosylierungsmotiv: Asparagin, dann ein beliebiger Rest außer Prolin, dann Serin oder Threonin, dann ein beliebiger Rest außer Prolin.

Wird meine Sequenz hochgeladen?

Nein. Alles läuft in deinem Browser, deine Sequenzen verlassen dein Gerät also nicht.