Поиск мотива
Как найти мотив в ДНК или белке
- Выберите ДНК или белок в поле «Тип последовательности» и вставьте последовательность, обычным текстом или в FASTA.
- Введите мотив. В ДНК коды IUPAC, такие как W или N, совпадают с любым из своих оснований; в белке X совпадает с любым остатком.
- Каждое совпадение показано с началом и концом, а для ДНК ещё и с цепью.
Частые вопросы
Можно ли использовать регулярное выражение?
Да. Шаблон с символами вроде [ ] ( ) * + или ? используется как регулярное выражение, например GC[AT]{2,4}GC.
Что находит N[^P][ST][^P]?
Мотив N-гликозилирования: аспарагин, затем любой остаток, кроме пролина, затем серин или треонин, затем любой остаток, кроме пролина.
Мои последовательности загружаются на сервер?
Нет. Всё работает в браузере, поэтому последовательности не покидают устройство.
Ещё инструменты для последовательностей ДНК и белков
Молекулярная масса ДНКМолекулярная масса белкаИзоэлектрическая точка белкаGRAVY белкаНечёткий поискИдентичность и сходствоПоиск ORFТрансляция ДНК в белокЕщё инструменты для последовательностей ДНК и белков (50)