Desen bulma

DNA’da ya da bir proteinde motif nasıl bulunur

1. Dizi türü’nden DNA ya da protein seç, sonra diziyi düz metin ya da FASTA olarak yapıştır.
2. Deseni yaz. DNA’da W ya da N gibi IUPAC kodları temsil ettikleri bazların herhangi biriyle eşleşir; proteinde X herhangi bir kalıntıyla eşleşir.
3. Her eşleşme başlangıcı ve sonuyla, DNA’da zinciriyle birlikte listelenir.

Sık sorulan sorular

Düzenli ifade kullanabilir miyim?

Evet. [ ] ( ) * + ya da ? gibi karakterler içeren bir desen düzenli ifade olarak kullanılır; örneğin GC[AT]{2,4}GC.

N[^P][ST][^P] neyi bulur?

N-glikozilasyon motifini: asparajin, ardından prolin dışında herhangi bir kalıntı, ardından serin ya da treonin, ardından prolin dışında herhangi bir kalıntı.

Dizilerim yükleniyor mu?

Hayır. Her şey tarayıcında çalışır; dizilerin cihazından çıkmaz.