প্যাটার্ন খুঁজুন

DNA বা প্রোটিনে কীভাবে মোটিফ খুঁজবেন

1. সিকোয়েন্সের ধরনে DNA বা প্রোটিন বেছে নিন, তারপর সিকোয়েন্সটি সাধারণ লেখা বা FASTA হিসেবে বসান।
2. প্যাটার্নটি লিখুন। DNA-তে W বা N-এর মতো IUPAC কোড তার যেকোনো ক্ষারকের সঙ্গে মেলে; প্রোটিনে X যেকোনো অবশেষের সঙ্গে মেলে।
3. প্রতিটি মিল তার শুরু আর শেষসহ, আর DNA-তে তার সূত্রসহ তালিকায় আসে।

সাধারণ প্রশ্ন

রেগুলার এক্সপ্রেশন ব্যবহার করতে পারি?

হ্যাঁ। [ ] ( ) * + বা ?-এর মতো অক্ষরওয়ালা প্যাটার্নকে রেগুলার এক্সপ্রেশন হিসেবে ধরা হয়, যেমন GC[AT]{2,4}GC।

N[^P][ST][^P] কী খুঁজে আনে?

N-গ্লাইকোসাইলেশনের মোটিফ: অ্যাসপারাজিন, তারপর প্রোলিন ছাড়া যেকোনো অবশিষ্টক, তারপর সেরিন বা থ্রিওনিন, তারপর প্রোলিন ছাড়া যেকোনো অবশিষ্টক।

আমার সিকোয়েন্স কি আপলোড হয়?

না। সবকিছু আপনার ব্রাউজারেই চলে, তাই আপনার সিকোয়েন্স কখনো যন্ত্র ছেড়ে যায় না।