البحث عن نمط

كيف تبحث عن موتيف في DNA أو بروتين

1. اختر DNA أو بروتين من نوع التسلسل، ثم الصق التسلسل نصًا عاديًا أو بصيغة FASTA.
2. اكتب النمط. في DNA تطابق رموز IUPAC مثل W أو N أيًّا من قواعدها، وفي البروتين يطابق X أي بقية.
3. يُعرض كل تطابق ببدايته ونهايته، وفي DNA بخيطه أيضًا.

الأسئلة الشائعة

هل يمكنني استخدام تعبير نمطي؟

نعم. النمط الذي فيه أحرف مثل [ ] ( ) * + أو ? يُستخدم كتعبير نمطي، مثلًا GC[AT]{2,4}GC.

ماذا يجد N[^P][ST][^P]؟

موتيف N-glycosylation: أسباراجين، ثم أي بقية عدا البرولين، ثم سيرين أو ثريونين، ثم أي بقية عدا البرولين.

هل يُرفع تسلسلي؟

لا. كل شيء يعمل في متصفحك، فلا تغادر تسلسلاتك جهازك أبدًا.