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Buscar patrón

Cómo buscar un motivo en ADN o en una proteína

  1. Elige ADN o proteína en Tipo de secuencia y pega la secuencia, como texto o en FASTA.
  2. Escribe el patrón. En ADN, los códigos IUPAC como W o N coinciden con cualquiera de sus bases; en una proteína, X coincide con cualquier residuo.
  3. Cada coincidencia aparece con su inicio y su final y, en ADN, con su cadena.

Preguntas frecuentes

¿Puedo usar una expresión regular?

Sí. Un patrón con caracteres como [ ] ( ) * + o ? se usa como expresión regular, por ejemplo GC[AT]{2,4}GC.

¿Qué encuentra N[^P][ST][^P]?

El motivo de N-glicosilación: asparagina, luego cualquier residuo salvo prolina, luego serina o treonina y luego cualquier residuo salvo prolina.

¿Se sube mi secuencia?

No. Todo funciona en tu navegador, así que tus secuencias nunca salen de tu dispositivo.

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