Cari Pola

Cara mencari motif dalam DNA atau protein

1. Pilih DNA atau protein di Jenis sekuens, lalu tempel sekuensnya, sebagai teks biasa atau FASTA.
2. Ketik polanya. Pada DNA, kode IUPAC seperti W atau N cocok dengan basa mana pun yang diwakilinya; pada protein, X cocok dengan residu apa pun.
3. Setiap kecocokan dicantumkan dengan awal dan akhirnya, dan untuk DNA juga untainya.

Pertanyaan umum

Bisakah saya memakai ekspresi reguler?

Ya. Pola dengan karakter seperti [ ] ( ) * + atau ? dipakai sebagai ekspresi reguler, misalnya GC[AT]{2,4}GC.

Apa yang ditemukan N[^P][ST][^P]?

Motif N-glikosilasi: asparagin, lalu residu apa pun kecuali prolin, lalu serin atau treonin, lalu residu apa pun kecuali prolin.

Apakah sekuens saya diunggah?

Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.