Buscar padrão

Como encontrar um motivo em DNA ou em uma proteína

1. Escolha DNA ou proteína em Tipo de sequência e cole a sequência, como texto ou em FASTA.
2. Digite o padrão. Em DNA, códigos IUPAC como W ou N correspondem a qualquer uma de suas bases; em uma proteína, X corresponde a qualquer resíduo.
3. Cada ocorrência aparece com início e fim e, em DNA, com a fita.

Perguntas frequentes

Posso usar uma expressão regular?

Sim. Um padrão com caracteres como [ ] ( ) * + ou ? é usado como expressão regular, por exemplo GC[AT]{2,4}GC.

O que N[^P][ST][^P] encontra?

O motivo de N-glicosilação: asparagina, depois qualquer resíduo exceto prolina, depois serina ou treonina, depois qualquer resíduo exceto prolina.

Minha sequência é enviada?

Não. Tudo roda no seu navegador, então suas sequências nunca saem do seu dispositivo.