Protein izoelektrik noktası
Bir proteinin izoelektrik noktası nasıl hesaplanır
- Bir ya da daha fazla protein dizisini düz metin veya FASTA olarak yapıştır.
- Her dizi için izoelektrik nokta görünür.
- Proteinin o pH’taki net yükünü görmek için pH’ı değiştir.
Sık sorulan sorular
pI nasıl hesaplanıyor?
Uçların ve her D, E, C, Y, H, K ve R’nin yükü pKa değerinden toplanır ve toplamın sıfır olduğu pH ikiye bölme yöntemiyle bulunur. pKa değerleri EMBOSS’un kullandıklarıdır.
Neden diğer hesaplayıcılardan farklı?
Her hesaplayıcı kendi pKa değerleri takımını kullanır; bu yüzden sonuçlar çoğu zaman birkaç onda bir pH birimi farklıdır. Hiçbiri katlanmayı ya da modifikasyonları hesaba katmaz.
Dizilerim yükleniyor mu?
Hayır. Her şey tarayıcında çalışır; dizilerin cihazından çıkmaz.
Diğer DNA ve protein dizisi araçları
Ters tamamlayıcıDNA’dan RNA’yaFASTA dizilerini birleştirFASTA dizisini bölGenBank’ten FASTA’yaEMBL’den FASTA’yaGenBank özellik çıkarıcıEMBL özellik çıkarıcıGenBank translasyon çıkarıcıEMBL translasyon çıkarıcıKodonlara bölDNA aralık çıkarıcıProtein aralık çıkarıcıDNA pencere çıkarıcıProtein pencere çıkarıcıDNA filtreleProtein filtreleDNA gruplaProtein gruplaTek harften üç harfli amino asit kodlarınaÜç harften tek harfli amino asit kodlarınaDNA istatistikleriProtein istatistikleriKodon kullanımıCpG adası bulucuDNA molekül ağırlığıProtein molekül ağırlığıProtein GRAVYDNA desen bulmaProtein desen bulmaDNA bulanık aramaProtein bulanık aramaÖzdeşlik ve benzerlikORF bulucuDNA’yı proteine çevirTers translasyonProtein hizalamasının ters translasyonuPCR primer istatistikleriPCR ürünleriKesim özetiKesim için mutasyonDNA ikili hizalamaProtein ikili hizalamaKodon ikili hizalamaKodon optimizasyonuCRISPR kılavuz bulucuKesim haritasıTranslasyon haritasıPrimer haritasıHizalamayı korunmuşluğa göre renklendirHizalamayı özelliklere göre renklendirKodon grafiğiPlazmit haritası görüntüleyiciRastgele DNA dizisiRastgele protein dizisiRastgele kodlayan DNARastgele DNA bölgeleriRastgele protein bölgeleriDNA örnekleProtein örnekleDNA karıştırProtein karıştırDNA mutasyonuProtein mutasyonuGenetik kodlarIUPAC kodları