Plazmit haritası görüntüleyici
Bir plazmit haritası nasıl çizilir
- Bir GenBank ya da EMBL dosyası yapıştır: Addgene, SnapGene, Benchling ya da NCBI’dan gelenlerin hepsi çalışır.
- Dairesel harita her özellik bir ok olarak görünür; özellik tablosu altındadır.
- Hangi kesim bölgelerinin gösterileceğini seç, sonra haritayı SVG olarak indir.
Sık sorulan sorular
Hangi dosyaları kullanabilirim?
Addgene, SnapGene, Benchling ve NCBI’ın dışa aktardığı GenBank (.gb, .gbk) ve EMBL dosyaları. Dizi tek başına yetmez: çizilecek bir şey olması için özelliklerin dosyada olması gerekir.
Bazı özellikler neden eksik?
source özelliği bütün plazmidi kapsadığı için dışarıda bırakılır ve kullanılabilir bir konumu olmayan her şey atlanır. Aracın çizdiği her şey özellik tablosunda listelenir; böylece ne okuduğunu görebilirsin.
Oklar ne anlama geliyor?
Her ok bir özelliktir ve okunduğu yönü gösterir. Örtüşen özellikler ayrı kalsınlar diye iç halkalara taşınır; renkler olağan geleneklere uyar: kodlayan diziler için mavi, promotörler için yeşil, sonlandırıcılar için kırmızı, başlangıç noktaları için mor, primer bölgeleri için turuncu.
Varsayılan olarak neden yalnızca tek kesenler?
Çünkü gerçekten klonlayabileceğin bölgeler bunlardır. 5 kb’lik bir plazmitte her bölgeyi göstermek yüzlerce etiket verir ve sana hiçbir şey söylemez.
Haritayı sonradan düzenleyebilir miyim?
Evet. İndirilen SVG gerçek şekillerden ve metinden oluşur; bu yüzden Inkscape, Illustrator ve Figma onu açabilir ve bir şekil için etiketleri taşıyabilir ya da renkleri değiştirebilirsin.
Dizilerim yükleniyor mu?
Hayır. Her şey tarayıcında çalışır; dizilerin cihazından çıkmaz.