Rastgele protein dizisi
Rastgele bir protein dizisi nasıl üretilir
- Uzunluğu ve dizi sayısını ayarla.
- «Oluştur»a tıkla.
- Her dizi, 20 standart amino asidin eşit olasılıklı olduğu bir FASTA kaydıdır.
Sık sorulan sorular
Metiyoninle başlıyor mu?
Hayır. Her konum rastgele çekilir. Bir başlangıç kodonu istiyorsan Rastgele kodlayan DNA aracını kullan.
Hangi amino asitleri kullanıyor?
Her konumda eşit olasılıklı 20 standart amino asidi.
Rastgele proteinler ne için kullanılır?
Hizalamalar, motif aramaları ve tahmin araçları için kontrol olarak: gerçek bir eşleşme aynı uzunluktaki rastgele dizilerden daha iyi puan almalıdır.
Diğer DNA ve protein dizisi araçları
Ters tamamlayıcıDNA’dan RNA’yaFASTA dizilerini birleştirFASTA dizisini bölGenBank’ten FASTA’yaEMBL’den FASTA’yaGenBank özellik çıkarıcıEMBL özellik çıkarıcıGenBank translasyon çıkarıcıEMBL translasyon çıkarıcıKodonlara bölDNA aralık çıkarıcıProtein aralık çıkarıcıDNA pencere çıkarıcıProtein pencere çıkarıcıDNA filtreleProtein filtreleDNA gruplaProtein gruplaTek harften üç harfli amino asit kodlarınaÜç harften tek harfli amino asit kodlarınaDNA istatistikleriProtein istatistikleriKodon kullanımıCpG adası bulucuDNA molekül ağırlığıProtein molekül ağırlığıProtein izoelektrik noktasıProtein GRAVYDNA desen bulmaProtein desen bulmaDNA bulanık aramaProtein bulanık aramaÖzdeşlik ve benzerlikORF bulucuDNA’yı proteine çevirTers translasyonProtein hizalamasının ters translasyonuPCR primer istatistikleriPCR ürünleriKesim özetiKesim için mutasyonDNA ikili hizalamaProtein ikili hizalamaKodon ikili hizalamaKodon optimizasyonuCRISPR kılavuz bulucuKesim haritasıTranslasyon haritasıPrimer haritasıHizalamayı korunmuşluğa göre renklendirHizalamayı özelliklere göre renklendirKodon grafiğiPlazmit haritası görüntüleyiciRastgele DNA dizisiRastgele kodlayan DNARastgele DNA bölgeleriRastgele protein bölgeleriDNA örnekleProtein örnekleDNA karıştırProtein karıştırDNA mutasyonuProtein mutasyonuGenetik kodlarIUPAC kodları