ORF bulucu
Açık okuma çerçeveleri nasıl bulunur
- Bir DNA dizisini düz metin ya da FASTA olarak yapıştır.
- Aranacak çerçeveleri, hangi başlangıç kodonlarının sayılacağını, en küçük uzunluğu ve genetik kodu seç.
- Her açık okuma çerçevesi çerçevesi, konumu ve uzunluğuyla DNA ya da protein olarak bir FASTA kaydı halinde listelenir.
Sık sorulan sorular
Ne açık okuma çerçevesi sayılıyor?
Bir başlangıç kodonundan aynı çerçevedeki bir sonraki durma kodonuna kadar olan bölüm. «Herhangi bir kodon» seçiliyken çerçeve bir durmadan sonraki herhangi bir kodondan itibaren açıktır.
Çerçeve numaralarını nasıl okurum?
+1, +2 ve +3 yapıştırıldığı haliyle dizinin çerçeveleridir; -1, -2 ve -3 ters tamamlayıcısının çerçeveleridir.
Dizilerim yükleniyor mu?
Hayır. Her şey tarayıcında çalışır; dizilerin cihazından çıkmaz.
Diğer DNA ve protein dizisi araçları
Ters tamamlayıcıDNA’dan RNA’yaFASTA dizilerini birleştirFASTA dizisini bölGenBank’ten FASTA’yaEMBL’den FASTA’yaGenBank özellik çıkarıcıEMBL özellik çıkarıcıGenBank translasyon çıkarıcıEMBL translasyon çıkarıcıKodonlara bölDNA aralık çıkarıcıProtein aralık çıkarıcıDNA pencere çıkarıcıProtein pencere çıkarıcıDNA filtreleProtein filtreleDNA gruplaProtein gruplaTek harften üç harfli amino asit kodlarınaÜç harften tek harfli amino asit kodlarınaDNA istatistikleriProtein istatistikleriKodon kullanımıCpG adası bulucuDNA molekül ağırlığıProtein molekül ağırlığıProtein izoelektrik noktasıProtein GRAVYDNA desen bulmaProtein desen bulmaDNA bulanık aramaProtein bulanık aramaÖzdeşlik ve benzerlikDNA’yı proteine çevirTers translasyonProtein hizalamasının ters translasyonuPCR primer istatistikleriPCR ürünleriKesim özetiKesim için mutasyonDNA ikili hizalamaProtein ikili hizalamaKodon ikili hizalamaKodon optimizasyonuCRISPR kılavuz bulucuKesim haritasıTranslasyon haritasıPrimer haritasıHizalamayı korunmuşluğa göre renklendirHizalamayı özelliklere göre renklendirKodon grafiğiPlazmit haritası görüntüleyiciRastgele DNA dizisiRastgele protein dizisiRastgele kodlayan DNARastgele DNA bölgeleriRastgele protein bölgeleriDNA örnekleProtein örnekleDNA karıştırProtein karıştırDNA mutasyonuProtein mutasyonuGenetik kodlarIUPAC kodları