DNA istatistikleri
Bazlar ve GC içeriği nasıl sayılır
- Bir ya da daha fazla DNA dizisini düz metin veya FASTA olarak yapıştır.
- Her dizi için A, C, G ve T sayıları, GC ve AT içeriği, pürinler, pirimidinler ve 16 dinükleotidin hepsi görünür.
- «Çıktıyı kopyala» ya da «İndir» sonucu kaydeder.
Sık sorulan sorular
GC içeriği nasıl hesaplanıyor?
G artı C’nin dizinin uzunluğuna bölümü. N gibi belirsizlik kodları «Diğer» altında uzunluğa sayılır; bu yüzden çok N içeren bir dizi daha düşük GC içeriği gösterir.
Dizilerim yükleniyor mu?
Hayır. Her şey tarayıcında çalışır; dizilerin cihazından çıkmaz.
DNA’yı 3B olarak görebilir miyim?
DNA ve RNA katlanma görüntüleyici tek bir ipliğin kendi üzerine nasıl katlandığını gösterir: gövdeler sarmal, ilmekler halka olarak; serbest enerjisi, erime sıcaklığı ve GC içeriğiyle.
Diğer DNA ve protein dizisi araçları
Ters tamamlayıcıDNA’dan RNA’yaFASTA dizilerini birleştirFASTA dizisini bölGenBank’ten FASTA’yaEMBL’den FASTA’yaGenBank özellik çıkarıcıEMBL özellik çıkarıcıGenBank translasyon çıkarıcıEMBL translasyon çıkarıcıKodonlara bölDNA aralık çıkarıcıProtein aralık çıkarıcıDNA pencere çıkarıcıProtein pencere çıkarıcıDNA filtreleProtein filtreleDNA gruplaProtein gruplaTek harften üç harfli amino asit kodlarınaÜç harften tek harfli amino asit kodlarınaProtein istatistikleriKodon kullanımıCpG adası bulucuDNA molekül ağırlığıProtein molekül ağırlığıProtein izoelektrik noktasıProtein GRAVYDNA desen bulmaProtein desen bulmaDNA bulanık aramaProtein bulanık aramaÖzdeşlik ve benzerlikORF bulucuDNA’yı proteine çevirTers translasyonProtein hizalamasının ters translasyonuPCR primer istatistikleriPCR ürünleriKesim özetiKesim için mutasyonDNA ikili hizalamaProtein ikili hizalamaKodon ikili hizalamaKodon optimizasyonuCRISPR kılavuz bulucuKesim haritasıTranslasyon haritasıPrimer haritasıHizalamayı korunmuşluğa göre renklendirHizalamayı özelliklere göre renklendirKodon grafiğiPlazmit haritası görüntüleyiciRastgele DNA dizisiRastgele protein dizisiRastgele kodlayan DNARastgele DNA bölgeleriRastgele protein bölgeleriDNA örnekleProtein örnekleDNA karıştırProtein karıştırDNA mutasyonuProtein mutasyonuGenetik kodlarIUPAC kodları