GC içeriği
GC içeriği G ya da C olan bazların payıdır: (G + C) ÷ uzunluk. ATGCGC’de 6’da 4, yani %66,7 vardır. G–C çiftlerinin iki yerine üç hidrojen bağı vardır; bu yüzden GC’ce zengin DNA daha yüksek sıcaklıkta erir; bu PCR primerleri ve problar için önemlidir. DNA istatistikleri baz sayımlarını, GC ve AT içeriğini ve dinükleotit sayımlarını verir.
Molekül ağırlığı
Hızlı bir tahmin, çift zincirli DNA için baz çifti başına yaklaşık 650 dalton, proteinler için amino asit başına yaklaşık 110 daltondur. DNA molekül ağırlığı ve Protein molekül ağırlığı araçları bunun yerine her bazın ya da kalıntının kesin kütlelerini toplar.
İzoelektrik nokta
İzoelektrik nokta (pI), bir proteinin net yükünün olmadığı pH’tır. Asidik ve bazik kalıntıların sayılarından ve her birinin pKa’sından tahmin edilir. Farklı pKa takımları birkaç onda bir farklı cevaplar verir; bu yüzden sonucu, örneğin iyon değişim kromatografisi için tampon seçerken bir yol gösterici olarak gör. Protein izoelektrik noktası her pH’taki yükü de verir.
GRAVY
Büyük ortalama hidropati, tüm kalıntıların Kyte–Doolittle hidropati değerlerinin ortalamasıdır. Pozitif değerler genel olarak hidrofobik, negatif değerler hidrofilik demektir; zar proteinleri çözünür olanlardan daha yüksek puan alma eğilimindedir. Protein GRAVY dizi boyunca her pencere için de bir hidropati değeri verir; yaklaşık 20 hidrofobik kalıntılık bölümler zar ötesi sarmallara işaret edebilir.
CpG adaları
CpG adaları, omurgalılarda çoğu zaman gen promotörlerinin yakınında bulunan, CG dinükleotitlerince zengin bölümlerdir. Yaygın bir tanım, GC içeriği %50’nin üstünde ve gözlenen/beklenen CpG oranı 0,6’nın üstünde, en az 200 bazlık bir penceredir; CpG adası bulucu varsayılan olarak bu ayarları kullanır.
Kodon kullanımı
Çoğu amino asidin birkaç kodonu vardır ve organizmalar bazılarını diğerlerine tercih eder. Bir kodon kullanım tablosu her birinin ne sıklıkla, bin kodon başına ve eşanlamlıları içindeki pay olarak kullanıldığını gösterir; bu bir geni başka bir organizmada ifade için uyarlarken yardımcı olur. Bkz. Kodon kullanımı ve amino asit bileşimi için Protein istatistikleri.