GC मात्रा
GC मात्रा उन क्षारों का हिस्सा है जो G या C हैं: (G + C) ÷ लंबाई। ATGCGC में 6 में से 4, यानी 66.7%। G–C जोड़ों में दो की जगह तीन हाइड्रोजन बंध होते हैं, इसलिए GC से भरपूर DNA ऊँचे तापमान पर पिघलता है, जो PCR प्राइमर और प्रोब के लिए मायने रखता है। DNA आँकड़े क्षारों की गिनती, GC और AT मात्रा और सभी डाइन्यूक्लियोटाइड देता है।
आणविक भार
जल्दी अंदाज़े के लिए डबल-स्ट्रैंड DNA लगभग 650 डाल्टन प्रति बेस पेयर, और प्रोटीन लगभग 110 डाल्टन प्रति अमीनो अम्ल होता है। DNA आणविक भार और प्रोटीन आणविक भार टूल इसके बजाय हर क्षार या रेज़िड्यू का सटीक द्रव्यमान जोड़ते हैं।
समविभव बिंदु
समविभव बिंदु (pI) वह pH है जिस पर प्रोटीन पर कोई शुद्ध आवेश नहीं होता। इसका अंदाज़ा अम्लीय और क्षारीय रेज़िड्यू की संख्या और हर एक के pKa से लगाया जाता है। pKa के अलग-अलग सेट कुछ दशमलव का फ़र्क देते हैं, इसलिए नतीजे को मार्गदर्शन की तरह लें, जैसे आयन-एक्सचेंज क्रोमैटोग्राफ़ी के लिए बफ़र चुनते समय। प्रोटीन समविभव बिंदु किसी भी pH पर आवेश भी बताता है।
GRAVY
ग्रैंड एवरेज ऑफ़ हाइड्रोपैथी सभी रेज़िड्यू के काइट–डूलिटल हाइड्रोपैथी मानों का औसत है। धनात्मक मान का मतलब कुल मिलाकर जलविरोधी, ऋणात्मक का मतलब जलस्नेही; मेम्ब्रेन प्रोटीन घुलनशील प्रोटीन से ज़्यादा अंक पाते हैं। प्रोटीन GRAVY सीक्वेंस पर हर विंडो के लिए हाइड्रोपैथी मान भी देता है, और लगभग 20 जलविरोधी रेज़िड्यू के खंड ट्रांसमेम्ब्रेन हेलिक्स का संकेत हो सकते हैं।
CpG द्वीप
CpG द्वीप CG डाइन्यूक्लियोटाइड से भरपूर खंड हैं, जो कशेरुकी जीवों में अक्सर जीन प्रमोटर के पास होते हैं। एक आम परिभाषा है कम से कम 200 क्षारों की विंडो जिसमें GC मात्रा 50% से ज़्यादा और देखे गए/अपेक्षित CpG का अनुपात 0.6 से ज़्यादा हो; CpG द्वीप खोजक डिफ़ॉल्ट रूप से यही सेटिंग लेता है।
कोडॉन उपयोग
ज़्यादातर अमीनो अम्लों के कई कोडॉन होते हैं, और हर जीव कुछ को ज़्यादा पसंद करता है। कोडॉन उपयोग तालिका दिखाती है कि हर कोडॉन कितनी बार इस्तेमाल होता है, प्रति हज़ार कोडॉन और अपने पर्यायों में हिस्से के रूप में, जो किसी जीन को दूसरे जीव में एक्सप्रेस करने के लिए ढालने में मदद करता है। कोडॉन उपयोग देखें, और अमीनो अम्ल संरचना के लिए प्रोटीन आँकड़े।