रिवर्स कॉम्प्लिमेंट क्यों ज़रूरी है
DNA में दो स्ट्रैंड होते हैं जो उलटी दिशाओं में चलते हैं। सीक्वेंस 5′ से 3′ लिखे जाते हैं, इसलिए दूसरा स्ट्रैंड, जब उसकी अपनी 5′ से 3′ दिशा में पढ़ा जाए, रिवर्स कॉम्प्लिमेंट होता है। रिवर्स प्राइमर डिज़ाइन करने, माइनस स्ट्रैंड पर मौजूद जीन पढ़ने, या उलटे स्ट्रैंड से आए सीक्वेंसिंग रीड की तुलना करने के लिए इसकी ज़रूरत पड़ती है।
हाथ से निकालें
- हर बेस को उसके जोड़ीदार से बदलें: A ↔ T और G ↔ C।
- नतीजे को उलटी ओर से पढ़ें।
5′-ATGCCTAG-3′ का कॉम्प्लिमेंट TACGGATC है और रिवर्स कॉम्प्लिमेंट 5′-CTAGGCAT-3′ है। बिना कॉम्प्लिमेंट किए सिर्फ़ उलटने पर GATCCGTA मिलता है, जो अलग सीक्वेंस है और यह आम गलती है।
ऐम्बिगुइटी कोड और RNA
IUPAC कोड के भी जोड़ीदार होते हैं: R (A या G) का जोड़ा Y (C या T) है, K का M, और B, D, H, V के जोड़े V, H, D, B हैं। S, W और N वैसे ही रहते हैं। RNA में T की जगह U होता है।
ब्राउज़र में करें
- रिवर्स कॉम्प्लिमेंट खोलें।
- एक सीक्वेंस पेस्ट करें, या FASTA फ़ॉर्मेट में कई।
- रिवर्स कॉम्प्लिमेंट, रिवर्स या कॉम्प्लिमेंट चुनें। टाइटल, छोटे-बड़े अक्षर और ऐम्बिगुइटी कोड बने रहते हैं।
T को U में बदलने के लिए DNA से RNA इस्तेमाल करें।