DNA 서열의 역상보 서열 구하는 방법

역상보 서열이 필요한 이유

DNA는 서로 반대 방향으로 달리는 두 가닥으로 되어 있습니다. 서열은 5′에서 3′ 방향으로 쓰기 때문에, 반대쪽 가닥을 그 가닥의 5′→3′ 방향으로 읽은 것이 역상보 서열입니다. 역방향 프라이머 설계, 음성 가닥에 있는 유전자 읽기, 반대 가닥에서 읽힌 시퀀싱 리드와의 비교에 필요합니다.

손으로 구하기

1. 염기를 각각 짝 염기로 바꿉니다: A ↔ T, G ↔ C.
2. 결과를 뒤에서부터 읽습니다.

5′-ATGCCTAG-3′의 상보 서열은 TACGGATC, 역상보 서열은 5′-CTAGGCAT-3′입니다. 상보 없이 뒤집기만 하면 GATCCGTA가 되는데, 이는 다른 서열입니다. 흔한 실수입니다.

축퇴 코드와 RNA

IUPAC 코드에도 짝이 있습니다. R(A 또는 G)은 Y(C 또는 T)와, K는 M과, B·D·H·V는 각각 V·H·D·B와 짝을 이룹니다. S·W·N은 그대로입니다. RNA에서는 T 대신 U를 씁니다.

브라우저에서 바꾸기

1. 역상보 서열을 엽니다.
2. 서열 하나, 또는 FASTA 형식으로 여러 개를 붙여 넣습니다.
3. 역상보·역순·상보 중 하나를 고릅니다. 제목, 대소문자, 축퇴 코드는 그대로 남습니다.

T를 U로 바꾸기만 한다면 DNA → RNA 변환을 쓰세요.