원
플라스미드 지도는 원형 DNA를 고리로 그리고, 맨 위 1번부터 시계 방향으로 번호를 매깁니다. 전체 크기는 가운데에 염기쌍으로 적힙니다. 화살표는 피처와 그 가닥을 나타내며, 시계 방향 화살표는 위 가닥에 있습니다.
거의 모든 플라스미드에 있는 부분
- 복제 기점(ori): 숙주 안에서 플라스미드가 복제되게 합니다. pUC 기점은 세포당 수백 개, p15A와 pSC101은 그보다 적은 사본을 만듭니다.
- 선택 마커: AmpR(앰피실린)이나 KanR(카나마이신) 같은 저항성 유전자로, 플라스미드가 있는 세포만 자라게 합니다.
- 프로모터: T7, lac, CMV, EF-1α처럼 삽입 유전자의 발현이 시작되는 곳입니다. 쓰는 숙주에서 작동하는지 확인하세요.
- 다중 클로닝 자리(MCS): 삽입 유전자를 넣기 위한 유일한 제한 부위가 모인 짧은 구간입니다.
- 태그와 종결자: His나 FLAG 태그, 삽입 유전자 뒤의 종결자.
제한 부위
지도에 표시된 부위는 대개 플라스미드를 한 번만 자르는 유일한 부위입니다. 클로닝할 때는 MCS의 유일한 부위 중 삽입 유전자 안은 자르지 않는 두 곳을 고르세요. 제한 효소 요약은 어떤 서열이든 한 번만 자르는 효소를 보여 주고, 제한 효소 지도는 그 위치를 보여 줍니다.
내 플라스미드 보기
GenBank 파일을 플라스미드 지도 보기에 붙여 넣으면 피처와 부위를 지도로 그릴 수 있습니다.