Lingkarannya
Peta plasmid menggambar DNA sirkular sebagai cincin, dinomori searah jarum jam mulai posisi 1 di atas. Ukuran totalnya tertulis di tengah, dalam pasangan basa. Panah menunjukkan fitur dan untainya: panah searah jarum jam ada di untai atas.
Bagian yang dimiliki hampir semua plasmid
- Titik awal replikasi (ori): membuat plasmid bisa menggandakan diri di inang. Ori pUC memberi ratusan salinan per sel; p15A dan pSC101 lebih sedikit.
- Penanda seleksi: gen resistansi seperti AmpR (ampisilin) atau KanR (kanamisin), sehingga hanya sel berplasmid yang tumbuh.
- Promotor: tempat ekspresi sisipan dimulai, seperti T7, lac, CMV, atau EF-1α. Pastikan bekerja di inang Anda.
- Situs kloning ganda (MCS): bagian pendek yang penuh situs restriksi unik untuk memasukkan sisipan.
- Tag dan terminator: tag His atau FLAG, dan terminator setelah sisipan.
Situs restriksi
Situs yang tertera di peta biasanya situs unik, yang memotong plasmid hanya sekali. Untuk kloning, pilih dua situs unik di MCS yang tidak juga memotong di dalam sisipan. Ringkasan Restriksi mencantumkan enzim pemotong tunggal pada sekuens apa pun, dan Peta Restriksi menunjukkan letaknya.
Lihat plasmid Anda sendiri
Tempel file GenBank ke Penampil Peta Plasmid untuk menggambar fitur dan situsnya sebagai peta.