Toolyard

Penampil Peta Plasmid

Cara menggambar peta plasmid

  1. Tempel berkas GenBank atau EMBL: berkas dari Addgene, SnapGene, Benchling, atau NCBI semuanya bisa.
  2. Peta bundarnya muncul dengan setiap fitur sebagai anak panah, dan tabel fiturnya di bawah.
  3. Pilih situs restriksi mana yang ditampilkan, lalu unduh petanya sebagai SVG.

Pertanyaan umum

Berkas apa saja yang bisa dipakai?

GenBank (.gb, .gbk) dan EMBL, yaitu yang diekspor Addgene, SnapGene, Benchling, dan NCBI. Sekuensnya saja tidak cukup: fiturnya harus ada di dalam berkas supaya ada yang digambar.

Mengapa ada fitur yang hilang?

Fitur source ditinggalkan karena ia menutupi seluruh plasmid, dan apa pun tanpa lokasi yang bisa dipakai dilewati. Semua yang digambar alat ini tercantum di tabel fitur, jadi Anda bisa melihat apa yang dibacanya.

Apa arti anak panahnya?

Setiap anak panah adalah satu fitur, menunjuk ke arah bacanya. Fitur yang bertumpang dipindahkan ke lingkaran dalam supaya tetap terpisah, dan warnanya mengikuti kebiasaan: biru untuk sekuens penyandi, hijau untuk promotor, merah untuk terminator, ungu untuk titik awal replikasi, jingga untuk situs primer.

Mengapa bawaannya hanya pemotong tunggal?

Karena itulah situs yang benar-benar bisa Anda pakai untuk mengklon. Menampilkan semua situs pada plasmid 5 kb memberi ratusan label dan tidak memberi tahu apa pun.

Bisakah petanya saya sunting setelahnya?

Bisa. SVG yang diunduh terdiri dari bentuk dan teks sungguhan, jadi Inkscape, Illustrator, dan Figma bisa membukanya dan Anda bisa memindahkan label atau mengubah warnanya untuk sebuah gambar.

Apakah sekuens saya diunggah?

Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.

Alat sekuens DNA dan protein lainnya