Plot Kodon
Cara memplot penggunaan kodon di sepanjang gen
- Tempel sekuens DNA penyandi, sesuai rangka.
- Jika mau, tempel tabel penggunaan kodon organisme inang. Tanpa tabel, gen itu sendiri yang dipakai.
- Setiap batang menunjukkan seberapa umum kodon itu di antara sinonimnya. Kodon di bawah fraksi yang Anda atur ditandai langka.
Pertanyaan umum
Mengapa mencari kodon langka?
Deretan kodon yang langka di inang bisa memperlambat translasi atau menimbulkan kesalahan saat gen diekspresikan di organisme lain, misalnya gen manusia di E. coli.
Apakah sekuens saya diunggah?
Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.
Alat sekuens DNA dan protein lainnya
Komplemen BalikDNA ke RNAGabungkan Sekuens FASTAPecah Sekuens FASTAGenBank ke FASTAEMBL ke FASTAEkstraktor Fitur GenBankEkstraktor Fitur EMBLEkstraktor Translasi GenBankEkstraktor Translasi EMBLPecah Menjadi KodonEkstraktor Rentang DNAEkstraktor Rentang ProteinEkstraktor Jendela DNAEkstraktor Jendela ProteinBersihkan DNABersihkan ProteinKelompokkan DNAKelompokkan ProteinAsam Amino Satu ke Tiga HurufAsam Amino Tiga ke Satu HurufStatistik DNAStatistik ProteinPenggunaan KodonPencari Pulau CpGBerat Molekul DNABerat Molekul ProteinTitik Isoelektrik ProteinGRAVY ProteinCari Pola DNACari Pola ProteinPencarian Mirip DNAPencarian Mirip ProteinIdentitas dan KemiripanPencari ORFTranslasi DNA ke ProteinTranslasi BalikTranslasi Balik Penyejajaran ProteinStatistik Primer PCRProduk PCRRingkasan RestriksiMutasi untuk DigestiSejajarkan Dua DNASejajarkan Dua ProteinSejajarkan KodonPeta RestriksiPeta TranslasiPeta PrimerWarnai Penyejajaran Menurut KonservasiWarnai Penyejajaran Menurut SifatSekuens DNA AcakSekuens Protein AcakDNA Penyandi AcakWilayah DNA AcakWilayah Protein AcakSampel DNASampel ProteinAcak Urutan DNAAcak Urutan ProteinMutasikan DNAMutasikan ProteinKode GenetikKode IUPAC