コドンプロット

遺伝子に沿ってコドン使用頻度をプロットする方法

1. コード DNA 配列を、読み枠を合わせて貼り付けます。
2. 必要なら宿主生物のコドン使用表を貼り付けます。貼り付けない場合は遺伝子そのものを使います。
3. 各バーはそのコドンが同義コドンの中でどれだけ多いかを示します。設定した割合を下回るコドンはまれなコドンとして示されます。

よくある質問

まれなコドンを探す理由は？

宿主でまれなコドンが続くと、ヒトの遺伝子を大腸菌で発現させる場合などに、翻訳が遅れたり誤りが起きたりすることがあります。

配列はアップロードされますか？

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。