Gráfico de códons
Como plotar o uso de códons ao longo de um gene
- Cole uma sequência de DNA codificante, em quadro.
- Se quiser, cole uma tabela de uso de códons do organismo hospedeiro. Sem ela, o próprio gene é usado.
- Cada barra mostra quão comum aquele códon é entre seus sinônimos. Códons abaixo da fração que você definir são marcados como raros.
Perguntas frequentes
Por que procurar códons raros?
Trechos de códons raros no hospedeiro podem atrasar a tradução ou causar erros ao expressar um gene em outro organismo, como um gene humano em E. coli.
Minha sequência é enviada?
Não. Tudo roda no seu navegador, então suas sequências nunca saem do seu dispositivo.
Mais ferramentas de sequências de DNA e proteína
Complemento reversoDNA para RNACombinar sequências FASTADividir sequência FASTAGenBank para FASTAEMBL para FASTAExtrator de features GenBankExtrator de features EMBLExtrator de traduções GenBankExtrator de traduções EMBLDividir em códonsExtrator de intervalos de DNAExtrator de intervalos de proteínaExtrator de janelas de DNAExtrator de janelas de proteínaLimpar DNALimpar proteínaAgrupar DNAAgrupar proteínaAminoácidos de uma para três letrasAminoácidos de três para uma letraEstatísticas de DNAEstatísticas de proteínaUso de códonsLocalizador de ilhas CpGPeso molecular de DNAPeso molecular de proteínaPonto isoelétrico de proteínaGRAVY de proteínaBuscar padrão em DNABuscar padrão em proteínaBusca aproximada em DNABusca aproximada em proteínaIdentidade e similaridadeLocalizador de ORFTraduzir DNA em proteínaTradução reversaTradução reversa de um alinhamento de proteínasAnálise de primers de PCRProdutos de PCRResumo de restriçãoMutar para digestãoAlinhar dois DNAAlinhar duas proteínasAlinhar códonsMapa de restriçãoMapa de traduçãoMapa de primersColorir alinhamento por conservaçãoColorir alinhamento por propriedadesSequência de DNA aleatóriaSequência de proteína aleatóriaDNA codificante aleatórioRegiões de DNA aleatóriasRegiões de proteína aleatóriasAmostrar DNAAmostrar proteínaEmbaralhar DNAEmbaralhar proteínaMutar DNAMutar proteínaCódigos genéticosCódigos IUPAC