Graphique des codons

Comment représenter l’usage des codons le long d’un gène

1. Collez une séquence d’ADN codante, en phase.
2. Si vous le souhaitez, collez une table d’usage des codons de l’organisme hôte. Sans elle, le gène lui-même est utilisé.
3. Chaque barre montre la fréquence de ce codon parmi ses synonymes. Les codons sous la fraction choisie sont marqués comme rares.

Questions fréquentes

Pourquoi chercher des codons rares ?

Des séries de codons rares chez l’hôte peuvent ralentir la traduction ou provoquer des erreurs quand un gène est exprimé dans un autre organisme, comme un gène humain dans E. coli.

Ma séquence est-elle envoyée ?

Non. Tout fonctionne dans votre navigateur : vos séquences ne quittent jamais votre appareil.