플라스미드 지도 보기
플라스미드 지도를 그리는 방법
- GenBank나 EMBL 파일을 붙여 넣습니다. Addgene, SnapGene, Benchling, NCBI의 파일은 모두 됩니다.
- 원형 지도가 특징마다 화살표와 함께 나오고, 아래에 특징 목록이 붙습니다.
- 어떤 제한효소 자리를 보일지 고르고, 지도를 SVG로 내려받습니다.
자주 묻는 질문
어떤 파일을 쓸 수 있습니까?
GenBank(.gb, .gbk)와 EMBL이며, Addgene과 SnapGene, Benchling, NCBI가 모두 내보내는 형식입니다. 서열만으로는 부족합니다. 그릴 것이 있으려면 특징이 파일에 들어 있어야 합니다.
왜 일부 특징이 빠집니까?
source는 플라스미드 전체를 덮으므로 빼고, 쓸 수 있는 위치가 없는 것은 건너뜁니다. 그린 것은 모두 특징 목록에 나오므로 도구가 무엇을 읽었는지 볼 수 있습니다.
화살표는 무엇을 뜻합니까?
화살표 하나가 특징 하나이고, 읽히는 방향을 가리킵니다. 겹치는 특징은 안쪽 고리로 옮겨 서로 떨어뜨리며, 색은 관례를 따릅니다. 코딩 서열은 파랑, 프로모터는 초록, 종결자는 빨강, 복제 시작점은 자주, 프라이머 자리는 주황입니다.
왜 기본이 한 번만 자르는 효소입니까?
실제로 클로닝에 쓸 수 있는 자리가 그것들이기 때문입니다. 5 kb 플라스미드의 모든 자리를 보이면 수백 개 이름이 붙고 아무것도 알 수 없습니다.
나중에 지도를 고칠 수 있습니까?
있습니다. 내려받은 SVG는 실제 도형과 글자로 되어 있어서 Inkscape, Illustrator, Figma로 열 수 있고, 그림을 만들 때 이름을 옮기거나 색을 바꿀 수 있습니다.
서열이 업로드되나요?
아니요. 모든 작업이 브라우저 안에서 이루어지므로 서열이 기기 밖으로 나가지 않습니다.
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