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Plasmidkarte anzeigen

Eine Plasmidkarte zeichnen

  1. Füge eine GenBank- oder EMBL-Datei ein: die von Addgene, SnapGene, Benchling oder NCBI gehen alle.
  2. Die runde Karte erscheint mit jedem Merkmal als Pfeil, darunter die Merkmalstabelle.
  3. Wähle, welche Schnittstellen gezeigt werden, und lade die Karte als SVG herunter.

Häufige Fragen

Welche Dateien kann ich nehmen?

GenBank (.gb, .gbk) und EMBL, also genau das, was Addgene, SnapGene, Benchling und NCBI ausgeben. Die Sequenz allein genügt nicht: die Merkmale müssen in der Datei stehen, sonst gibt es nichts zu zeichnen.

Warum fehlen manche Merkmale?

Das Merkmal source bleibt weg, weil es das ganze Plasmid umfasst, und alles ohne brauchbare Lage wird übersprungen. Was gezeichnet wurde, steht in der Merkmalstabelle, du siehst also, was gelesen wurde.

Was bedeuten die Pfeile?

Jeder Pfeil ist ein Merkmal und zeigt in seine Leserichtung. Merkmale, die sich überlappen, wandern auf innere Ringe, damit sie getrennt bleiben, und die Farben folgen der Gewohnheit: blau für codierende Sequenzen, grün für Promotoren, rot für Terminatoren, violett für Replikationsursprünge, orange für Primerstellen.

Warum voreingestellt nur Einzelschnitte?

Weil das die Stellen sind, in die du wirklich klonieren kannst. Alle Stellen eines 5-kb-Plasmids zu zeigen ergibt hunderte Beschriftungen und sagt nichts.

Kann ich die Karte danach bearbeiten?

Ja. Das heruntergeladene SVG besteht aus echten Formen und Texten, Inkscape, Illustrator und Figma öffnen es also, und du kannst für eine Abbildung Beschriftungen verschieben oder Farben ändern.

Wird meine Sequenz hochgeladen?

Nein. Alles läuft in deinem Browser, deine Sequenzen verlassen dein Gerät also nicht.

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