वृत्त
प्लाज़्मिड मैप वृत्ताकार DNA को एक छल्ले की तरह दिखाता है, जिसमें ऊपर स्थिति 1 से घड़ी की दिशा में नंबर लगे होते हैं। कुल आकार बीच में बेस पेयर में लिखा होता है। तीर फ़ीचर और उनका स्ट्रैंड दिखाते हैं: घड़ी की दिशा वाले तीर ऊपरी स्ट्रैंड पर हैं।
लगभग हर प्लाज़्मिड के हिस्से
- प्रतिकृति का मूल (ori): प्लाज़्मिड को मेज़बान में अपनी प्रतियाँ बनाने देता है। pUC ori प्रति कोशिका सैकड़ों प्रतियाँ देते हैं; p15A और pSC101 कम।
- चयन मार्कर: AmpR (एम्पिसिलिन) या KanR (कैनामाइसिन) जैसा प्रतिरोध जीन, ताकि सिर्फ़ प्लाज़्मिड वाली कोशिकाएँ बढ़ें।
- प्रोमोटर: जहाँ से इन्सर्ट की अभिव्यक्ति शुरू होती है, जैसे T7, lac, CMV या EF-1α। जाँचें कि यह आपके मेज़बान में काम करता है।
- मल्टीपल क्लोनिंग साइट (MCS): इन्सर्ट डालने के लिए अद्वितीय प्रतिबंधन स्थलों से भरा छोटा हिस्सा।
- टैग और टर्मिनेटर: His या FLAG टैग, और इन्सर्ट के बाद एक टर्मिनेटर।
प्रतिबंधन स्थल
मैप पर दिखाए गए स्थल आम तौर पर अद्वितीय होते हैं, जो प्लाज़्मिड को सिर्फ़ एक बार काटते हैं। क्लोनिंग के लिए MCS में दो ऐसे अद्वितीय स्थल चुनें जो आपके इन्सर्ट के अंदर भी न काटें। प्रतिबंधन सारांश किसी भी अनुक्रम के सिंगल कटर बताता है, और प्रतिबंधन मैप दिखाता है कि वे कहाँ हैं।
अपना प्लाज़्मिड देखें
फ़ीचर और स्थलों को मैप पर देखने के लिए GenBank फ़ाइल प्लाज़्मिड मैप व्यूअर में चिपकाएँ।