हेडर
- LOCUS: नाम, बेस पेयर में लंबाई, अणु का प्रकार (DNA, mRNA), रेखीय या वृत्ताकार, और एक तारीख़।
- DEFINITION: एक पंक्ति का विवरण।
- ACCESSION और VERSION: रिकॉर्ड की ID, जैसे NM_000546.6। बिंदु के बाद की संख्या अनुक्रम बदलने पर बदलती है।
- SOURCE और ORGANISM: अनुक्रम कहाँ से आया।
- REFERENCE: इसे बताने वाले शोध-पत्र।
FEATURES
हर फ़ीचर का एक प्रकार (gene, CDS, promoter, misc_feature) और एक लोकेशन होती है, उसके बाद /gene="TP53", /product= या /translation= जैसे क्वालिफ़ायर, जिसमें CDS का प्रोटीन अनुक्रम होता है।
100..500: ऊपरी स्ट्रैंड पर बेस 100 से 500।complement(100..500): वही बेस, उल्टे स्ट्रैंड पर पढ़े गए।join(100..200,300..450): जोड़े गए टुकड़े, जैसे किसी जीन के एक्सॉन।<1..300या200..>900: फ़ीचर अनुक्रम के सिरे से आगे जाता है।
ORIGIN
ख़ुद अनुक्रम, छोटे अक्षरों में दस-दस के ब्लॉक में, हर पंक्ति की शुरुआत में स्थिति के साथ, और अंत में //।
इसके साथ काम करना
GenBank से FASTA कन्वर्टर संख्याएँ और स्पेस हटाकर वह सादा अनुक्रम देता है जो ज़्यादातर टूल चाहते हैं। फ़ीचर्स को मैप पर देखने के लिए फ़ाइल को प्लाज़्मिड मैप व्यूअर में खोलें। पूरक स्ट्रैंड पर मौजूद फ़ीचर 5' से 3' अपनी रेंज के रिवर्स कॉम्प्लिमेंट की तरह पढ़ा जाता है।