Por qué importa la complementaria inversa
El ADN tiene dos hebras que van en sentidos opuestos. Las secuencias se escriben de 5′ a 3′, así que la otra hebra, leída en su propio sentido 5′ a 3′, es la complementaria inversa. La necesitas para diseñar un cebador reverso, leer un gen que está en la hebra negativa o comparar una lectura de secuenciación que salió de la hebra opuesta.
Calcularla a mano
- Cambia cada base por su pareja: A ↔ T y G ↔ C.
- Lee el resultado al revés.
Para 5′-ATGCCTAG-3′ la complementaria es TACGGATC y la complementaria inversa es 5′-CTAGGCAT-3′. Invertir sin complementar da GATCCGTA, que es otra secuencia y un error frecuente.
Códigos de ambigüedad y ARN
Los códigos IUPAC también tienen pareja: R (A o G) se empareja con Y (C o T), K con M, y B, D, H y V con V, H, D y B. S, W y N no cambian. En el ARN, U ocupa el lugar de T.
Hazlo en el navegador
- Abre Complementaria inversa.
- Pega una secuencia, o muchas en formato FASTA.
- Elige complementaria inversa, inversa o complementaria. Se conservan los títulos, las mayúsculas y minúsculas y los códigos de ambigüedad.
Para cambiar T por U, usa ADN a ARN.