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タンパク質の GRAVY

タンパク質の GRAVY を計算する方法

  1. 1本または複数のタンパク質配列を、プレーンテキストか FASTA で貼り付けます。
  2. 各配列の GRAVY スコアが表示されます。
  3. プロファイルのウィンドウを設定すると、配列に沿った平均ハイドロパシーを位置ごとに確認できます。

よくある質問

GRAVY スコアは何を表しますか?

すべての残基の Kyte-Doolittle ハイドロパシーの平均です。正の値は疎水性、負の値は親水性のタンパク質を示します。

ウィンドウはいくつにすればよいですか?

表面領域なら 9 前後、膜貫通ヘリックスを探すなら 19〜21 です。

配列はアップロードされますか?

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。

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