タンパク質の GRAVY

タンパク質の GRAVY を計算する方法

1. 1本または複数のタンパク質配列を、プレーンテキストか FASTA で貼り付けます。
2. 各配列の GRAVY スコアが表示されます。
3. プロファイルのウィンドウを設定すると、配列に沿った平均ハイドロパシーを位置ごとに確認できます。

よくある質問

GRAVY スコアは何を表しますか？

すべての残基の Kyte-Doolittle ハイドロパシーの平均です。正の値は疎水性、負の値は親水性のタンパク質を示します。

ウィンドウはいくつにすればよいですか？

表面領域なら 9 前後、膜貫通ヘリックスを探すなら 19〜21 です。

配列はアップロードされますか？

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。