性質でアラインメントを色分け
タンパク質アラインメントを性質で色分けする方法
- ギャップを - で書いた FASTA 形式のタンパク質アラインメントを貼り付けます。
- 各残基が化学的性質で色分けされ、アラインメントの上に凡例が表示されます。
- ダウンロードで色付きのアラインメントをウェブページとして保存できます。
よくある質問
どの色が使われますか?
疎水性(A V L I M F W Y)、酸性(D E)、塩基性(K R H)、極性(S T N Q)、グリシンとプロリン、システインにそれぞれ別の色が付きます。
配列はアップロードされますか?
いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。
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