2本の DNA をアライン

2本の DNA 配列をアラインする方法

1. 2本の DNA 配列を貼り付けます。
2. 一致・ミスマッチのスコアと、ギャップ開始・伸長のペナルティを設定します。一方の配列がもう一方の中に含まれる場合は、末端ギャップを無料にするにチェックを入れます。
3. アラインをクリックすると、同一性、ギャップ、スコア付きのアラインメントが表示されます。

よくある質問

どの手法を使っていますか？

アフィンギャップペナルティによるグローバルアラインメント（Needleman-Wunsch）です。長いギャップ1つのほうが短いギャップ多数よりコストが低くなります。

配列はどのくらいの長さまで扱えますか？

アラインメント全体をブラウザ内で計算するため、およそ 5,000 × 5,000 文字までです。

配列はアップロードされますか？

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。