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Alinear dos proteínas

Cómo alinear dos secuencias de proteína

  1. Pega las dos secuencias de proteína.
  2. Indica las penalizaciones de apertura y extensión de gap, y marca la opción de gaps en los extremos si una secuencia es un fragmento de la otra.
  3. Haz clic en Alinear para ver el alineamiento con la identidad, la similitud, los gaps y la puntuación.

Preguntas frecuentes

¿Qué matriz de puntuación usa?

BLOSUM62, con un alineamiento global (Needleman-Wunsch) y penalizaciones de gap afines.

¿Qué significan los símbolos entre las líneas?

Una barra vertical marca residuos idénticos y dos puntos, residuos similares.

¿Se sube mi secuencia?

No. Todo funciona en tu navegador, así que tus secuencias nunca salen de tu dispositivo.

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