Aligner deux protéines
Comment aligner deux séquences protéiques
- Collez les deux séquences protéiques.
- Réglez les pénalités d’ouverture et d’extension de gap, et cochez Gaps terminaux gratuits si une séquence est un fragment de l’autre.
- Cliquez sur Aligner pour voir l’alignement avec l’identité, la similarité, les gaps et le score.
Questions fréquentes
Quelle matrice de score est utilisée ?
BLOSUM62, avec un alignement global (Needleman-Wunsch) et des pénalités de gap affines.
Que signifient les symboles entre les lignes ?
Une barre verticale marque les résidus identiques et deux-points les résidus similaires.
Ma séquence est-elle envoyée ?
Non. Tout fonctionne dans votre navigateur : vos séquences ne quittent jamais votre appareil.
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