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Alinhar duas proteínas

Como alinhar duas sequências de proteína

  1. Cole as duas sequências de proteína.
  2. Defina as penalidades de abertura e extensão de gap, e marque a opção de gaps nas extremidades se uma sequência for fragmento da outra.
  3. Clique em Alinhar para ver o alinhamento com identidade, similaridade, gaps e pontuação.

Perguntas frequentes

Qual matriz de pontuação é usada?

BLOSUM62, com um alinhamento global (Needleman-Wunsch) e penalidades de gap afins.

O que os símbolos entre as linhas significam?

Uma barra vertical marca resíduos idênticos e dois pontos marcam resíduos similares.

Minha sequência é enviada?

Não. Tudo roda no seu navegador, então suas sequências nunca saem do seu dispositivo.

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