প্লাজমিড ম্যাপ দর্শক

একটি প্লাজমিড ম্যাপ কীভাবে আঁকবেন

1. একটি GenBank বা EMBL ফাইল সেঁটে দিন: Addgene, SnapGene, Benchling বা NCBI-র — সবই চলে।
2. বৃত্তাকার ম্যাপটি চলে আসে, প্রতিটি বৈশিষ্ট্য একটি তিরচিহ্ন হিসেবে, আর নিচে বৈশিষ্ট্যের টেবিল।
3. কোন রেস্ট্রিকশনের জায়গাগুলো দেখাবেন তা বেছে নিন, তারপর ম্যাপটি একটি SVG হিসেবে নামিয়ে নিন।

সাধারণ প্রশ্ন

কোন ফাইলগুলো ব্যবহার করতে পারি?

GenBank (.gb, .gbk) আর EMBL ফাইল, যা Addgene, SnapGene, Benchling আর NCBI সবাই বের করে দেয়। শুধু সিকোয়েন্সটি যথেষ্ট নয়: আঁকার মতো কিছু থাকতে হলে বৈশিষ্ট্যগুলোও ফাইলে থাকতে হবে।

কিছু বৈশিষ্ট্য নেই কেন?

source বৈশিষ্ট্যটি বাদ দেওয়া হয়, কারণ তা পুরো প্লাজমিডই ঢেকে রাখে, আর কাজে লাগার মতো অবস্থান ছাড়া সবকিছুই বাদ পড়ে যায়। যন্ত্রটি যা যা এঁকেছে তা বৈশিষ্ট্যের টেবিলে তালিকায় থাকে, তাই সে কী পড়েছে তা দেখে নিতে পারেন।

তিরচিহ্নগুলোর মানে কী?

প্রতিটি তিরচিহ্ন একটি বৈশিষ্ট্য, যা যেদিকে পড়া হয় সেদিকেই তাক করে থাকে। যে বৈশিষ্ট্যগুলো একের ওপরে আরেকটা পড়ে, সেগুলো ভেতরের বলয়ে সরিয়ে দেওয়া হয়, যাতে আলাদাই থাকে, আর রংগুলো চলতি রীতিই মানে: কোডিং সিকোয়েন্সে নীল, প্রোমোটারে সবুজ, টার্মিনেটরে লাল, আদি বিন্দুতে বেগুনি, প্রাইমারের জায়গায় কমলা।

আগে থেকেই কেবল এক-কাটা এনজাইম কেন?

কারণ ওই জায়গাগুলোতেই আপনি সত্যিকার অর্থে ক্লোন করতে পারেন। একটি 5 kb প্লাজমিডের প্রতিটি জায়গা দেখালে শত শত নাম আসে আর তাতে কিছুই জানা যায় না।

ম্যাপটি পরে সম্পাদনা করতে পারি?

হ্যাঁ। নামিয়ে নেওয়া SVG-টি সত্যিকারের আকার আর লেখা দিয়ে গড়া, তাই Inkscape, Illustrator আর Figma তা খুলতে পারে, আর একটি চিত্রের জন্য আপনি নাম সরাতে বা রং বদলাতে পারেন।

আমার সিকোয়েন্স কি আপলোড হয়?

না। সবকিছু আপনার ব্রাউজারেই চলে, তাই আপনার সিকোয়েন্স কখনো যন্ত্র ছেড়ে যায় না।