Sítio de reconhecimento de SpeI
SpeI em resumo
5' A|CTAGT 3' 3' TGATC|A 5'
| Sítio de reconhecimento | 5'-ACTAGT-3' |
| Corte | A^CTAGT |
| Extremidades | uma extremidade 5' protuberante de 4 bases (CTAG) |
| Frequência esperada | cerca de uma vez a cada 4.096 pb em DNA aleatório |
| Extremidades compatíveis | AvrII, NheI, XbaI |
Como encontrar sítios de SpeI em uma sequência
- Cole uma sequência de DNA ou um registro FASTA na caixa acima. SpeI já está preenchida em Só estas enzimas.
- Marque DNA circular se for um plasmídeo, para encontrar também um sítio que passe do fim para o início.
- O mapa marca cada corte de SpeI com a posição. Copie ou baixe o resultado abaixo dele.
Perguntas frequentes
Que sequência a SpeI corta?
A SpeI reconhece ACTAGT (escrita de 5' para 3') e corta a fita superior em A^CTAGT.
A SpeI deixa extremidades coesivas ou cegas?
Extremidades coesivas: uma extremidade 5' protuberante de 4 bases (CTAG).
Quais enzimas deixam extremidades compatíveis com a SpeI?
AvrII, NheI e XbaI. As protuberâncias são iguais, então as extremidades podem ser ligadas entre si.
Com que frequência a SpeI corta?
Um sítio como ACTAGT aparece cerca de uma vez a cada 4.096 pb em DNA aleatório. Sequências reais variam, então confira a sua acima.
Enzimas de restrição
Mapa de restriçãoSítio de reconhecimento de AatIISítio de reconhecimento de AccISítio de reconhecimento de AflIISítio de reconhecimento de AgeISítio de reconhecimento de AluISítio de reconhecimento de ApaISítio de reconhecimento de ApaLISítio de reconhecimento de AscISítio de reconhecimento de AvaISítio de reconhecimento de AvrIISítio de reconhecimento de BamHISítio de reconhecimento de BclISítio de reconhecimento de BglIISítio de reconhecimento de BsiWISítio de reconhecimento de BspHISítio de reconhecimento de BsrGISítio de reconhecimento de BssHIISítio de reconhecimento de BstBISítio de reconhecimento de ClaISítio de reconhecimento de DraISítio de reconhecimento de EagISítio de reconhecimento de EcoRISítio de reconhecimento de EcoRVSítio de reconhecimento de FseISítio de reconhecimento de HaeIIISítio de reconhecimento de HhaISítio de reconhecimento de HincIISítio de reconhecimento de HindIIISítio de reconhecimento de HinfISítio de reconhecimento de HpaISítio de reconhecimento de KpnISítio de reconhecimento de MfeISítio de reconhecimento de MluISítio de reconhecimento de MseISítio de reconhecimento de MspISítio de reconhecimento de NaeISítio de reconhecimento de NcoISítio de reconhecimento de NdeISítio de reconhecimento de NheISítio de reconhecimento de NotISítio de reconhecimento de NruISítio de reconhecimento de NsiISítio de reconhecimento de PacISítio de reconhecimento de PmeISítio de reconhecimento de PstISítio de reconhecimento de PvuISítio de reconhecimento de PvuIISítio de reconhecimento de RsaISítio de reconhecimento de SacISítio de reconhecimento de SacIISítio de reconhecimento de SalISítio de reconhecimento de Sau3AISítio de reconhecimento de ScaISítio de reconhecimento de SfiISítio de reconhecimento de SmaISítio de reconhecimento de SnaBISítio de reconhecimento de SphISítio de reconhecimento de SspISítio de reconhecimento de StuISítio de reconhecimento de SwaISítio de reconhecimento de TaqISítio de reconhecimento de XbaISítio de reconhecimento de XhoISítio de reconhecimento de XmaI
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