تحليل بادئات PCR
كيف تفحص بادئات PCR
- الصق البادئات بادئًا في كل سطر، مع اسم اختياري قبل كل تسلسل، أو بصيغة FASTA.
- حدد تركيز البادئ وتركيز الصوديوم لدرجة الانصهار بطريقة الجار الأقرب.
- يظهر كل بادئ مع طوله ومحتوى GC وثلاث درجات انصهار ووزنه الجزيئي وأي تحذيرات.
الأسئلة الشائعة
أي درجة انصهار أستخدم؟
درجة الجار الأقرب هي الأدق. الصيغة الأساسية تضيف 2 °C لكل A أو T و4 °C لكل G أو C في البادئات القصيرة، مع صيغة GC للطويلة؛ والمعدلة بالملح تصححها حسب الصوديوم.
ماذا تفحص التحذيرات؟
طول خارج 18-30 قاعدة، ومحتوى GC خارج 40-60%، وغياب G أو C عند الطرف '3، وأكثر من 3 G أو C في آخر 5 قواعد، وتكرارات من 5 قواعد متماثلة أو أكثر، وامتدادات متتامة ذاتيًا قد تكوّن دبابيس شعر أو ثنائيات بادئات.
هل يُرفع تسلسلي؟
لا. كل شيء يعمل في متصفحك، فلا تغادر تسلسلاتك جهازك أبدًا.
مزيد من أدوات تسلسلات الحمض النووي والبروتين
المتمم العكسيDNA إلى RNAدمج تسلسلات FASTAتقسيم تسلسل FASTAGenBank إلى FASTAEMBL إلى FASTAمستخرج ميزات GenBankمستخرج ميزات EMBLمستخرج ترجمات GenBankمستخرج ترجمات EMBLالتقسيم إلى كودوناتمستخرج نطاقات DNAمستخرج نطاقات البروتينمستخرج نوافذ DNAمستخرج نوافذ البروتينتنظيف DNAتنظيف البروتينتجميع DNAتجميع البروتينالأحماض الأمينية من حرف إلى ثلاثة أحرفالأحماض الأمينية من ثلاثة أحرف إلى حرفإحصاءات DNAإحصاءات البروتيناستخدام الكودوناتباحث جزر CpGالوزن الجزيئي لـ DNAالوزن الجزيئي للبروتيننقطة التعادل الكهربائي للبروتينGRAVY للبروتينالبحث عن نمط في DNAالبحث عن نمط في البروتينبحث تقريبي في DNAبحث تقريبي في البروتينالتطابق والتشابهباحث ORFترجمة DNA إلى بروتينالترجمة العكسيةالترجمة العكسية لمحاذاة بروتيناتنواتج PCRملخص التقييدالطفر من أجل الهضممحاذاة تسلسلي DNAمحاذاة بروتينينمحاذاة الكودوناتتحسين الكودوناتباحث أدلة CRISPRخريطة التقييدخريطة الترجمةخريطة البادئاتتلوين المحاذاة حسب الحفظتلوين المحاذاة حسب الخصائصمخطط الكودوناتعارض خرائط البلازميداتتسلسل DNA عشوائيتسلسل بروتين عشوائيDNA مشفِّر عشوائيمناطق DNA عشوائيةمناطق بروتين عشوائيةعيّنات DNAعيّنات البروتينخلط DNAخلط البروتينطفر DNAطفر البروتينالشفرات الوراثيةرموز IUPAC