عارض خرائط البلازميدات

كيف ترسم خريطة بلازميد

1. الصق ملف GenBank أو EMBL: ملفات Addgene وSnapGene وBenchling وNCBI كلها تصلح.
2. تظهر الخريطة الدائرية مع كل ميزة كسهم، وجدول الميزات تحتها.
3. اختر مواقع التقييد التي تُعرض ونزّل الخريطة بصيغة SVG.

الأسئلة الشائعة

ما الملفات التي يمكنني استخدامها؟

GenBank (.gb و.gbk) وEMBL، وهي ما تصدّره Addgene وSnapGene وBenchling وNCBI. التسلسل وحده لا يكفي: يجب أن تكون الميزات في الملف ليكون هناك ما يُرسم.

لماذا تغيب بعض الميزات؟

تُترك ميزة source لأنها تمتد على البلازميد كله، ويُتخطى ما ليس له موقع صالح للاستخدام. كل ما رُسم يظهر في الجدول، فتستطيع رؤية ما قرأته الأداة.

ماذا تعني الأسهم؟

كل سهم ميزة ويشير إلى اتجاه قراءتها. المتداخلة تنتقل إلى حلقات داخلية كي لا تتراكب، والألوان تتبع العرف: الأزرق للتسلسلات المشفِّرة، والأخضر للمحفِّزات، والأحمر للمنهيات، والبنفسجي لمناشئ التضاعف، والبرتقالي لمواقع البادئات.

لماذا القطع الفريدة فقط افتراضيًا؟

لأنها المواقع التي يمكنك الاستنساخ فيها فعلًا. عرض كل المواقع في بلازميد طوله 5 kb يعطي مئات التسميات ولا يفيد بشيء.

هل يمكنني تعديل الخريطة بعد ذلك؟

نعم. ملف SVG المنزَّل مكوّن من أشكال ونصوص حقيقية، فيفتحه Inkscape وIllustrator وFigma ويمكنك نقل التسميات أو تغيير الألوان لشكل توضيحي.

هل يُرفع تسلسلي؟

لا. كل شيء يعمل في متصفحك، فلا تغادر تسلسلاتك جهازك أبدًا.