Toolyard

Situs Pengenalan BclI


Ringkasan BclI

5' T|GATCA 3'
3' ACTAG|T 5'
Situs pengenalan5'-TGATCA-3'
PotonganT^GATCA
Ujungujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (GATC)
Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak
Ujung yang kompatibelBamHI, BglII, Sau3AI

Cara menemukan situs BclI dalam sekuens

  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. BclI sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan BclI beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.

Pertanyaan umum

Sekuens apa yang dipotong BclI?

BclI mengenali TGATCA (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di T^GATCA.

Apakah BclI menghasilkan ujung lengket atau tumpul?

Ujung lengket: ujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (GATC).

Enzim apa yang menghasilkan ujung yang kompatibel dengan BclI?

BamHI, BglII, dan Sau3AI. Bagian menggantungnya sama, jadi ujung-ujungnya bisa diligasi satu sama lain.

Seberapa sering BclI memotong?

Situs seperti TGATCA muncul sekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.

Enzim restriksi

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Panduan